Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3bQ62141 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms