Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2aQ62066 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms