Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd1Q61345 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd1Q61345 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms