Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irf9Q61179 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf9Q61179 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms