Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamb3Q61087 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamb3Q61087 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms