Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna1Q60960 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms