Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms