Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r1bQ60829 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms