Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgaeQ60677 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms