Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf1Q5U4C3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms