Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms