Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms