Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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