Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rapgef6Q5NCJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rapgef6Q5NCJ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms