Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata48Q5NC83 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata48Q5NC83 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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