Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms