Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp22Q5DU02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms