Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1lQ5D525 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms