Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp13Q5BKP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms