Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2f8Q58FA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f8Q58FA4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms