Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrig2Q52KR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms