Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnl1Q52KE7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms