Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q504N7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q504N7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q504N7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q504N7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q504N7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q504N7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q504N7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q504N7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q504N7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms