Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M2

Lrrc36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc36Q3V0M2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc36Q3V0M2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc36Q3V0M2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc36Q3V0M2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms