Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms