Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate2Q3UW31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate2Q3UW31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms