Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT80

Gm1587, Predicted gene 1587, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1587Q3UT80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm1587Q3UT80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1587Q3UT80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1587Q3UT80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms