Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28047Q3US59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms