Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc4Q3UP24 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc4Q3UP24 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms