Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms