Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtcl1Q3UHU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mtcl1Q3UHU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtcl1Q3UHU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms