Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Greb1Q3UHK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Greb1Q3UHK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms