Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zyg11bQ3UFS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zyg11bQ3UFS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms