Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnft2Q3UF64 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms