Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Yipf3Q3UDR8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms