Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip13Q3UA06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms