Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf180Q3U827 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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