Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U6N9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3U6N9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms