Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmf1Q3U3R4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmf1Q3U3R4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmf1Q3U3R4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmf1Q3U3R4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms