Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pbxip1Q3TVI8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbxip1Q3TVI8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms