Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c3Q3TMP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms