Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4cQ3TKR3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp4cQ3TKR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms