Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms