Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prr27Q3SYJ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr27Q3SYJ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms