Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd163Q2VLH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd163Q2VLH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd163Q2VLH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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