Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna5Q2MKA5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms