Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpusd2Q149F1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
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