Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3ip1Q149C2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf3ip1Q149C2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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