Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cntnap5bQ0V8T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5bQ0V8T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5bQ0V8T8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5bQ0V8T8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5bQ0V8T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms