Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5cQ0V8T7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms